臺灣為中國北海上橫跨在溫熱兩帶之孤島。內部有高峻山脈蜿蜒起伏，因熱帶性山林之特徵，即過溼之大氣滂溥之結果，難免有固有風土病之存在。故其對住民之不良影響，夙為識者所共認，亦為事實所證明。史學家羅德偉・里斯〔Ludwig Riess〕著『臺灣島史』云：『往時曾駐在本島西南部之荷蘭宣教師等，始終痛嘆受其風土之痛苦。』 。西元一八八二、三年間，博物學者〔Guillemard F.H.H.〕搭乘英國軍艦Marchesa，隨從巡航中國海上，於登陸臺灣東部之際，留其異評謂：『Formosa乃不適宜居住之美麗島也』 ，可引之為旁證， 似亦可謂此觀感之表示。
不只荷蘭人觀感如是， 其實一六一六年就已經有日本人來到台灣從事貿易，欲試渡航之日本人，也因其水土不服屢傷健康而死於非命者，為數不少，所以 感覺上日本人足跡所以竟絕於在臺灣出現，實因無力抵抗瘴癘所致。過去日本人何以放棄臺灣，不得不為瘴氣之毒刃而投降，雖然從來不辭任何冒險而勇敢之日本人也不得不認輸。一八九五領臺之後，因瘴癘死亡人數遠多於戰死者，完成攻台任務後， 日本皇室成員近衞師團北白川宮能久親王因瘴癘，在台南去逝 ，致使日本政府一度想放棄臺灣。
外國人到臺灣者亦有不服水土不少為瘴癘而犧牲：
道光二十六年〔西元一八四六年〕美國人 J. C. Hepburn 為基督教傳道駐打狗港，不幸其六名家屬，病死四人 ，Hepburn 夫婦亦罹患瘧疾，停留未久迫不得已而回國。
光緒十一年〔西元一八八五年〕中法戰爭時，法國水師提都孤拔 S. Courbet ，在澎湖媽宮港罹病，為瘴癘而犧牲，成為不歸之客。
漢人對於瘴癘威脅的認識仍相當淺陋，屬於一種宿命或迷信的態度。
明代以臺灣為根據地，肆行打劫於海上之漢人海盜，亦難免受瘴癘威脅。前有林道乾可從『噶瑪蘭廳志』之規制海防附考載曰：『蘇澳………相傳自明嘉靖四十二年間，林道乾海盜，曾踞數月；以夥伴病損過多，始行徒去。』之後又有顏思齊，其事蹟如『臺灣外記』所寫：『天啟五年九月，顏思齊因往諸羅山打圍回來歡飲過度，隨感風寒，自知不起。』隨即葬於現今嘉義縣水上鄉 牛椆埔。
明鄭據臺後，由根據地廈門、金門等地，雖獎勵文武百官及兵民攜眷陸續渡臺，但有如下情形：『臺地初闢，水土不服，病者即死，故致各島搬眷，俱遷延不前。』〔臺灣外記〕而極為躊躇不前。鄭成功本人，力強體壯，據臺僅半載，偶染熱症享年三十九，似於血氣正旺時死去。 同時，明兵部尚書盧若騰抵澎湖未達三日，即罹病而亡。所謂的『熱症』應該是現今尚未根除的『登革熱』 ，而染瘧疾者，病徵較明顯。盧若騰詠從軍東都民之逸事詩云：『驚聞海東水土惡，征人疾疫十而九』。
鄭成功、陳永華之早亡，與瘟疫有關。康熙二十年（1681年），臺灣疫．先是有神曰天行使者，來居安平鎮陳永華宅，永華相與酬接．自是鄭氏之主臣眷屬凋喪殆盡。〔重纂福建通志卷〕
康熙七年，清將施琅所奏『盡陳海上情形疏』曰：『原住臺灣者有二、三萬人〔指明鄭部隊及漢人移住者〕，………此數年彼處不服水土病故及傷亡者五、六千』等語。 此數目非僅專舉出病故者，且數目上難免有誇張，假設對二萬住民有五千人之死亡率，則其死亡率等於百分之二十五，若對於住民三萬有死亡六千人，則可知其死亡率達百分之二十。以此可得到證明，當時之漢人受水土不服之影響，其損失有多大。
『臺灣外記』記載『康熙二十一年〔明鄭永曆三十六年〕三月，出汛雞籠山諸軍士，大發疾病。………越八月，死者過半。』
康熙三十六年，郁永河滯台五個月，一行五十五人，其中有二十餘名之輕重病者實例，七月十五日至十八日共四日間之事曰：『七月望，炎暑漸退，新涼襲人。其明日有三人忽稱病，十七日，病者又五人，十八日悉不起，………』等。更有敘述淡水港口之情形曰：『惟安平水師撥兵十人，率半歲一更，而水師弁卒，又視為畏途，扁舟至社，信宿即返。十五、六年城中無戍兵之跡矣！歲久荒蕪，入者輒死，為鬼為毒，人無由之知，汛守之設，特虛名耳。』應該是無力抵抗瘴癘所致而疑神疑鬼，為何平埔族人世世代代在這塊土地可以安居樂業，應與遺傳因子有関吧！
據『諸羅縣志』之雜記，載康熙三十八年，清軍討伐北路吞霄社番之際，七閱月〔二月至八月止〕之間，中瘴毒死者達數百人。
康熙五十二年，北路參將阮蔡文，巡察臺灣北部所傳記事曰：『北路地方千里，半線以上民少番多，大肚、牛罵、吞霄、竹塹諸處，山川奧鬱，水土苦惡，南崁、淡水窮年陰霧，罕晴霽，所產硫黃毒氣薰蒸，鄭氏以投罪人，庚寅始設淡水防兵，及瓜生還歲不能三分之一，有巡哨未至者，文決計往，部曲皆涕泣強諌』等。阮蔡文竟亦於中途染瘴氣不癒，以之照應。
康熙六十年，朱一貴事件時，福建省之水陸各標弁兵從征官軍征討，而於其六、七兩月間病亡者數甚多，此事有如『平臺紀略』曰：『時臺中癘疫盛行，從征將士冒炎威，宿風露，惡氣薰蒸，水土不服，疾病亡故者多。』可徵為佐證。
『台海使槎錄』所收赤崁筆談之風信相下，記述澹水〔北路淡水〕光景如下：『在磺山之下。日出，磺氣上騰，東風一發，感觸易病。雨則磺水入河，食之往往得病以死。七、八月，芒花飛颺入水，染疾益眾，風候與他處迴異。』。
『續修臺灣縣志』之政志項下記載，乾隆十五年臺灣縣署移建事由云：『宰斯邑者多遽歿，或以病劇去。十餘年中，經七令，無一秩滿者；眾以為不祥。』想是由中國各地蒞任知縣之官員，因不服水土罹瘴癘之因。
乾隆五十二年八月，林爽文事件時之臺灣府城守備狀況云：『時霪雨連旬，水平四野，我軍自內地來者，十病五、六，郡城以外，盡為賊踞。』以此可想見新撥兵勇因風土不服，而戰鬪力受影響。此實係臺灣於乾隆年間，對於赴臺視為畏途。康熙末年如之知縣之官，雖係為諸羅、鳳山縣治所在地，亦借辭毒惡瘴地，而不肯赴任地者，實非無因也。
為何漢人及外國人受臺灣瘴癘威脅如此厲害，而平埔族先民受瘴癘威脅較小，應與遺傳因子有関吧！或平埔族先民對檳榔不離口有関。荷蘭人在臺灣拓殖之初，交付西拉雅蕭壟社〔後之蕭壟堡蕭壟庄〕平埔族人所需之印度牛〔即水牛及黃牛〕 並贈與西拉雅人椰子及檳榔樹苗。『彰化縣志』風俗志云『惟檳榔可為散煙瘴之物，則不論貧富，不分老壯，皆嚼不離口，所以有黑齒之譏也。』。『臺灣府志』物產云『食之能醉人可以祛瘴。』
領軍攻臺之日本皇室成員，近衞師團北白川宮能久親王在澳底登陸
近衞師團北白川宮能久親王攻臺時之各地臨時行館
近衞師團北白川宮能久親王攻臺時之各地臨時行館
完成攻台任務後，近衞師團北白川宮能久親王因瘴癘，在台南去逝
日本人對台灣瘴癘的描述『台地多疫病，瘴癘、鼠疫為最慘者。鼠病俗呼草疫，又曰瘟疫，以當期奉風漸動之時發生也。鼠疫之發也，鼠必斃於屋之內外，其毒浸染人體，是以稱鼠病。此疫流行之時，土人戒不食餅果油葷等，蓋鼠疫多嗜糖類也。我文武官之在臺者，大抵為瘴癘所染，重者一再病而殪，輕者經五、六十回而不死。唯屢罹者，氣血哭喪，歸國而後尚不能脫者，往往有焉。此病之發，或每日、或隔日而患之，不違時間而來。先感惡寒，忽而戰慄眩暈，如以磐石壓頭腦。或苦吟發囈語，似病風者。佐倉孫三《臺風雜記》。』日本接收台灣之乙未年戰役，戰死有 164人，負傷 515人，病死 4624人，患病者 26094人，感染瘧疾最多，死亡以霍亂最多，可見臺灣當時之瘴癘有夠厲害。為何平埔族人不帕瘴癘，遺傳基因是最大的関係。
